口袋奇兵50级以后的关卡难度显著提升，主要体现在资源消耗、兵种搭配和战术策略的复杂性上。50级后玩家需要面对高强度的中立建筑争夺战、联盟建筑守卫战以及方舟争夺战，这些战斗对英雄强度、兵种等级和阵容搭配有更高要求。例如方舟争夺战中，敌方守卫通常具备高爆发伤害或群体控制能力，若未提前调整克制兵种或携带减伤技能，极易造成大量战损。50级解锁的黑暗兵团副本中，暗黑使者等BOSS关卡需要优先清理小怪再集中输出，否则会被持续消耗兵力。
军功系统的引入进一步增加了50级后关卡的挑战性。玩家在联盟建筑或中立建筑中与其他服务器玩家交战时，击杀敌方士兵可获得军功，但若敌方等级高于自身10级或低于50级则无法获得积分。这一机制要求玩家必须精准控制战斗节奏，避免越级挑战或无效战斗。军功商店中的稀有道具兑换需要长期积累，因此高效刷军功成为后期核心目标之一。部分关卡如群雄争霸的军团城池宝箱奖励，还需协调联盟成员共同完成，对团队配合提出更高要求。
科技升级所需物资呈指数级增长，而体力分配直接影响效率。建议优先将体力用于战锤集结而非单刷野怪，因为战锤掉落科技箱能均衡三军资源，而黑暗兵团副本虽单项材料暴利但稳定性差。修理工厂的合理使用也至关重要，防御战败的士兵可通过修理工厂恢复且不降级，但主动攻击阵亡的士兵会直接降级，需谨慎权衡攻防策略。
50级后英雄需解锁全部技能槽并提升天赋等级，例如橙色英雄需620个碎片升至五星，单条天赋升满还需400-440个碎片。T0级英雄如马克西莫（空军减伤+前排增伤）和莎琳娜（群体增益）在后期副本中表现突出，而T1级英雄如威震天（全军攻击加成）则需依赖专属技能强化。需英雄羁绊属性虽全局生效但加成有限，应优先投资军火库的武器强化等直接提升战力的途径。
关卡机制的特殊性也增加了通关难度。例如荒废研究所第三关要求先清理小怪再对抗暗黑使者BOSS，且推荐使用危险流浪者等清场能力强的英雄。幸存者关卡则需利用地形阻挡和兵种克制，避免正面硬拼。部分限时活动如暗月节的暗影迷宫副本，需组队应对高血量怪物，若队伍缺乏治疗或控制角色极易团灭。这些设计迫使玩家必须动态调整阵容，而非依赖固定套路。
50级后的关卡难度提升是多维度的，需综合资源规划、英雄养成、战术应变和联盟协作来应对。优先完成日常任务和限时活动以稳定获取经验值，同时保持兵种等级与主力军差距不超过5-10级，确保应对不同克制关系时的灵活性。后期玩法更注重长期积累与细节优化，盲目追求速通反而会增加资源压力。
